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制備YAC DNA進(jìn)行Southern印跡分析

發(fā)布時(shí)間： 2021-12-24　　點(diǎn)擊次數： 866次

材料與儀器
酵母菌
AHC SCE SCEM Tris·Cl EDTA TE 乙酸甲 RNase A 異丙醇 NaCl
培養箱離心管轉子
步驟

1. 接種一個(gè)紅色的含YAC克隆的酵母菌落于盛有20 ml AHC培養基的250 ml 三角燒瓶中，在旋轉搖床上30℃ 250 r/min 振蕩培養24 h。

2. 擴大培養：取1ml 由步驟1獲得的粉紅色菌懸液接種于盛有100 ml AHC培養基的 1 000 ml三角燒瓶中，于30℃ 250 r/min搖床培養24 h。

3. 將菌懸液移入2個(gè)50 ml 的錐形離心管中，于2 000 g 離心5 min，棄上清，共用5 ml SCE緩沖液重懸菌體，并合并到一個(gè)試管中。

4. 加1 ml SCEM緩沖液，在旋轉搖床中37℃ 100 r/min 輕搖晃混勻。

5. 于4℃ 2 000 g 離心棄上清，菌體用5 ml Tris/EDTA裂解液重懸。

6. 加0.5 ml 10%SDS顛倒混合數次，于65℃溫育20 min。

7. 加2 ml 冰浴的5 mol/l pH4.8的乙酸甲緩沖液，顛倒混合數次后置于冰浴60 min。

8. 于室溫2 000 g 離心10 min，小心將含核酸的上清轉移到一個(gè)新管中。加室溫2倍體積的95%乙醇，顛倒混勻。

9. 于室溫2 000 g 離心5 min，棄上清，在室溫晾干10~15 min，分別加入3 ml TE緩沖液，pH8.0于37℃過(guò)夜溶解核酸。

10. 加入0.1 ml 的1 mg/ml 無(wú)DNA酶活性的RNase A，于37℃溫育1 h。

11. 加入6 ml 室溫的異丙醇，振蕩并顛倒混勻后用一支毛細管纏繞起染色體，然后溶于0.5 ml TE緩沖液中。

12. 加入50 μl 5 mol/l NaCl和2 ml 95%乙醇，顛倒混勻。

13. 再一次纏繞起染色體DNA，并溶于0.5 ml TE緩沖液中，于4℃保存備用。

14. 取毎小份2 μg 的YAC DNA和15 μg 用以構建YAC文庫的某物種或個(gè)體的基因組DNA。

15. 采用幾種高頻切割的限制性?xún)惹忻高M(jìn)行酶切，接著(zhù)用單拷貝探針進(jìn)行雜交和核酸印跡分析。

16. 一旦通過(guò)核酸印跡實(shí)驗確證YAC克隆，那么可通過(guò)制備染色體凝膠校塊塞和進(jìn)行脈沖電場(chǎng)凝膠電泳，來(lái)明確重組YAC的大小并對其穩定性進(jìn)行初步評價(jià)。

同實(shí)驗其他方法
YAC 克隆的分析實(shí)驗
1. 用接種棒將含重組載體pYAC的AB1380菌株劃線(xiàn)接種在A(yíng)HC平板上，倒扣平板于30℃培養，直至長(cháng)出1~3 mm 大小的紅色菌落為止。 2. 短期保存：用Parafilm膜將平
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